More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1688 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  100 
 
 		 399 aa  782    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  65.83 
 
 		 398 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  66.92 
 
 		 402 aa  528  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  67.09 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  62.66 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  63.5 
 
 		 402 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  61.52 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0771  ammonium transporter  59.69 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00637331  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  56.25 
 
 		 399 aa  431  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  54.18 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  52.49 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  51.9 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  51.74 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  51.74 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  51.49 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  52.48 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  48.88 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  49.63 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  48.51 
 
 		 410 aa  378  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  48.76 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  49.63 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  48.27 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  48.27 
 
 		 411 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  48.27 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  48.51 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  48.27 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  48.27 
 
 		 410 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  48.02 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  50.5 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  50.38 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  50.25 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.9 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  48.27 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  46.32 
 
 		 489 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  49.12 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  47.99 
 
 		 464 aa  354  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  45.48 
 
 		 515 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  47.28 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  46.19 
 
 		 485 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  49.12 
 
 		 405 aa  350  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  44.76 
 
 		 515 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  44.21 
 
 		 496 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  43.75 
 
 		 507 aa  346  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  46.42 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  48.74 
 
 		 411 aa  342  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  45.27 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  43.46 
 
 		 521 aa  342  7e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  46.52 
 
 		 431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  46.35 
 
 		 402 aa  335  7e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  45.39 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  47.74 
 
 		 401 aa  333  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  45.16 
 
 		 444 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  46.13 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  46.13 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  49 
 
 		 423 aa  329  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  48.09 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  46.78 
 
 		 470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  44.13 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  44.53 
 
 		 474 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.03 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  44.9 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  47.89 
 
 		 433 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  44.8 
 
 		 494 aa  321  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  45.12 
 
 		 500 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  44.63 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  44.88 
 
 		 500 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  44.88 
 
 		 500 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  44.88 
 
 		 500 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  44.63 
 
 		 500 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  44.63 
 
 		 466 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  44.63 
 
 		 466 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  44.63 
 
 		 469 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  44.63 
 
 		 500 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  44.63 
 
 		 466 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  45.05 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  43.71 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  44.63 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  44.63 
 
 		 478 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  45.36 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  42.25 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  44.02 
 
 		 472 aa  315  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  43.24 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  43.32 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  44.34 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  44.83 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  45.05 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  46.59 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  44.8 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  43.17 
 
 		 501 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  45.48 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  44.15 
 
 		 504 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  45.91 
 
 		 435 aa  312  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  43.75 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  45.12 
 
 		 499 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  42.16 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  43.73 
 
 		 432 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  43.76 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  43.7 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  42.36 
 
 		 435 aa  309  4e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  42.09 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>