More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3648 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  755    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
349 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.47 
 
 
1099 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2089  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
493 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 
752 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0985  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
482 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  hitchhiker  0.00119227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 
1120 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
497 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
523 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 
1118 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01470  glycosyl transferase  27.08 
 
 
481 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312762  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 
1124 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3497  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
496 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  30.12 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  30.12 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
637 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.73 
 
 
1101 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  28.12 
 
 
412 aa  87  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
1002 aa  85.9  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.3 
 
 
1115 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 
1154 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
549 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  29.47 
 
 
422 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.67 
 
 
1119 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  28.46 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.37 
 
 
1115 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 
1115 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.88 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.37 
 
 
927 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
428 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.94 
 
 
872 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  25.57 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  26.38 
 
 
480 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.72 
 
 
1115 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  24.63 
 
 
478 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  26.27 
 
 
452 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1657  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
732 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0588308  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
512 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 
464 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.31 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.72 
 
 
451 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 
395 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  26.03 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  24.11 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  26.03 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  26.03 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  24.11 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  24.11 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 
507 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
445 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
445 aa  69.3  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  24.91 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  24.81 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1232  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  23.89 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  25.65 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  25.65 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  25.65 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  23.46 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
789 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
789 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
789 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  26.75 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  26.75 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  26.75 
 
 
441 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
441 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  26.75 
 
 
441 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  26.75 
 
 
441 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  26.75 
 
 
441 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  25.25 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  25.25 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
445 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
1184 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
443 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
479 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
484 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
479 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
425 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
425 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 
479 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  23.55 
 
 
418 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
475 aa  63.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
772 aa  63.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>