More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3532 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  63.43 
 
 
765 aa  782    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  61.04 
 
 
631 aa  751    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  67 
 
 
662 aa  822    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  100 
 
 
698 aa  1424    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  59.85 
 
 
711 aa  803    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  63.31 
 
 
693 aa  775    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  67.5 
 
 
638 aa  832    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  60.61 
 
 
778 aa  764    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  65.22 
 
 
680 aa  798    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  62.62 
 
 
731 aa  793    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  81.35 
 
 
637 aa  1054    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  65.43 
 
 
632 aa  845    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  71.04 
 
 
635 aa  902    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  66.13 
 
 
645 aa  832    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  32.71 
 
 
685 aa  209  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  32.15 
 
 
703 aa  208  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  32.99 
 
 
693 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  47.66 
 
 
496 aa  207  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  32.39 
 
 
692 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  32.5 
 
 
692 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  30.95 
 
 
571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  31.76 
 
 
652 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  29.42 
 
 
579 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  31.35 
 
 
558 aa  146  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  30.13 
 
 
648 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.59 
 
 
794 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  29.81 
 
 
575 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  30 
 
 
537 aa  137  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.35 
 
 
563 aa  137  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  29.74 
 
 
558 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.5 
 
 
794 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  29 
 
 
566 aa  136  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  32.6 
 
 
558 aa  134  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.82 
 
 
807 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  27.23 
 
 
819 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  27.02 
 
 
819 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  30.34 
 
 
650 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  27.7 
 
 
810 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  28.88 
 
 
639 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  29.53 
 
 
570 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  27.93 
 
 
670 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  28.32 
 
 
798 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  29.09 
 
 
570 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  31.33 
 
 
557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  29.52 
 
 
560 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  28.04 
 
 
814 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  27.43 
 
 
823 aa  120  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  31.47 
 
 
556 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  25.48 
 
 
787 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.7 
 
 
783 aa  117  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  27.2 
 
 
786 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.63 
 
 
810 aa  117  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  25.73 
 
 
786 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  31.01 
 
 
655 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.1 
 
 
790 aa  116  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  28.05 
 
 
810 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  25.86 
 
 
805 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.05 
 
 
805 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  29.4 
 
 
619 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  29.4 
 
 
619 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.86 
 
 
805 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  25.86 
 
 
805 aa  115  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.58 
 
 
805 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  28.15 
 
 
831 aa  114  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  25.84 
 
 
795 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  25.8 
 
 
805 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  28.21 
 
 
572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  30.7 
 
 
557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  26.33 
 
 
786 aa  112  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  26.36 
 
 
825 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  27.64 
 
 
821 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.13 
 
 
805 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  26.33 
 
 
806 aa  111  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  28.1 
 
 
806 aa  111  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  36.76 
 
 
816 aa  111  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  27.31 
 
 
803 aa  110  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  27.16 
 
 
817 aa  110  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  30.48 
 
 
557 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.31 
 
 
805 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  35.91 
 
 
810 aa  110  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  28.73 
 
 
844 aa  110  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  26.45 
 
 
800 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  24.19 
 
 
777 aa  110  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  30.48 
 
 
556 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  30.18 
 
 
556 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  35.09 
 
 
774 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  35.98 
 
 
804 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  37.04 
 
 
805 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  25.05 
 
 
791 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  36.59 
 
 
805 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.06 
 
 
816 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  24.4 
 
 
807 aa  108  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.24 
 
 
802 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  30.77 
 
 
798 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  30.26 
 
 
556 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  30.26 
 
 
557 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  30.26 
 
 
557 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  30.26 
 
 
556 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  30.26 
 
 
557 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  35.94 
 
 
797 aa  107  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>