221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3510 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3510  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.875172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.25 
 
 
314 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3136  hypothetical protein  34.69 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37880  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.52 
 
 
314 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 
343 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3018  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
329 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0766964 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0680  hypothetical protein  29.97 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0679  hypothetical protein  30.4 
 
 
343 aa  119  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0681  hypothetical protein  26.79 
 
 
353 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  26.13 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  26.28 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  26.13 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  26.28 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  25.55 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  27.34 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  26.56 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  26.89 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  26.05 
 
 
286 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  26.05 
 
 
286 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0614  hypothetical protein  33 
 
 
121 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
294 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  29.46 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  26.05 
 
 
286 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
351 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
302 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
291 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 
354 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.72 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 
301 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
290 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.73 
 
 
285 aa  52.8  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  26.79 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
324 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
463 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  25.62 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.73 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.9 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  23.26 
 
 
346 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 
282 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.32 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
322 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  22.61 
 
 
454 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  25.62 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  26.32 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  26.32 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 
297 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  33 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
258 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
309 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4016  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
300 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  32 
 
 
266 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  32 
 
 
266 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  32 
 
 
266 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
332 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2198  alpha/beta hydrolase fold  20.69 
 
 
343 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00385806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  32 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  26.19 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  32 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  23.58 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  26.67 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  32 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>