More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4016 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4016  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
300 aa  597  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 
280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  28.77 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  39.47 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.54 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 
271 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
271 aa  62.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
327 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 
275 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  34.75 
 
 
263 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  30.95 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
263 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  27.15 
 
 
271 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  34.15 
 
 
256 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 
310 aa  60.1  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  31.33 
 
 
265 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 
271 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  35.77 
 
 
256 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
305 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  36.73 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  30.07 
 
 
258 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
284 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
316 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  36.97 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
277 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.74 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  31.69 
 
 
341 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  34.81 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  33.04 
 
 
261 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  33.06 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.52 
 
 
370 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  39.09 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  39.09 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.16 
 
 
392 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.91 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  39.26 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.26 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.93 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.26 
 
 
372 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  30.07 
 
 
258 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.43 
 
 
368 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.43 
 
 
368 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
332 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29.38 
 
 
286 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 
351 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 
328 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  38.18 
 
 
256 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.43 
 
 
368 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.08 
 
 
262 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
264 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
291 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
267 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
294 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
276 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
276 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5899  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>