More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2217 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  681    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  29.61 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  29.23 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  26.76 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  26.19 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  26.19 
 
 		 336 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  26.11 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  28.16 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  27.79 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  27.93 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  27.69 
 
 		 339 aa  89.7  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 393 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  23.42 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  24.92 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  23.67 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  24.5 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  23.68 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  26.81 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  21.88 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  22.05 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  23.5 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  21.41 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  22.64 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  21.1 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.19 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  21.1 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  24.7 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  23.68 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  25.84 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  22.55 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  24.77 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  23.81 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  23.86 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  22.03 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  21.25 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.16 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  21.71 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.4 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  23.95 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  22.4 
 
 		 436 aa  62.8  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  24.16 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.58 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  20.55 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  20.33 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  23.03 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  23.51 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  22.6 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  22.85 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  24.13 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.69 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  21.13 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  20.91 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  22.74 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  23.27 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  24.36 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  27.11 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  25.53 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  19.94 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  21.65 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  20.74 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  22.7 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  21.17 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  22.76 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  21.66 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  22.87 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  20.05 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  20.53 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  23.63 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  25 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  20.64 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  22.01 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  20.64 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  20.64 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  20.64 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  20.64 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  24.29 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  20.56 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  20.64 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  20.83 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  20.64 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  20.05 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  21.26 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  21.04 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  20.83 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  20.06 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  22.67 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  20.81 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  21.69 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  20.05 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  23.9 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  21.53 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  19.63 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  25.42 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  22.05 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  22.3 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  21.02 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  23.55 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  23.36 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>