More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0965 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  542  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  45.14 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  43.46 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  34.51 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  29.71 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  25.08 
 
 		 427 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  25.08 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  26.28 
 
 		 423 aa  68.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  24.81 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  27.04 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  23.53 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 859 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  23.68 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.58 
 
 		 769 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  26.71 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  29.41 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.8 
 
 		 1274 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.51 
 
 		 903 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  27.22 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  26.14 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.52 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  20.75 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  23.03 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  33.86 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  30.3 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  24.77 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  32.79 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  27.21 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  27.21 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  26.04 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  26.17 
 
 		 907 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  23.99 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  23.42 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  27.34 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  25.79 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  29.27 
 
 		 411 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  24.62 
 
 		 140 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  21.99 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  33.93 
 
 		 144 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  21.28 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 142 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.68 
 
 		 845 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  33.64 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.49 
 
 		 161 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.17 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  26.72 
 
 		 154 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  26.35 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  22.31 
 
 		 385 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  25.62 
 
 		 379 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 1643 aa  52.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  24.73 
 
 		 155 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1329  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 209 aa  52.4  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 133 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2035  hypothetical protein  31.68 
 
 		 148 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  28.1 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  26.58 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  23.91 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.03 
 
 		 152 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  25.52 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  21.54 
 
 		 385 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  26.12 
 
 		 138 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  23.86 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  21.68 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  30.83 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  28.81 
 
 		 164 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  28.25 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 		 145 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  27.64 
 
 		 620 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  25.83 
 
 		 590 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  25.17 
 
 		 149 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 		 907 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 		 873 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  28.57 
 
 		 413 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  30.94 
 
 		 142 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  21.12 
 
 		 723 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  28.24 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0795  CBS domain containing protein  28.07 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  29.08 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  27.94 
 
 		 890 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  28.15 
 
 		 413 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.46 
 
 		 489 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  32.81 
 
 		 155 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  27.13 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  24.03 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  23.66 
 
 		 1560 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.98 
 
 		 1344 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.24 
 
 		 503 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.43 
 
 		 145 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4909  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  26.21 
 
 		 517 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.636899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  23.25 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 143 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>