54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0300 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  59.15 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  58.64 
 
 		 236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  55.61 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  54.09 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  54.79 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  58.37 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  32.27 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  31.11 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  29.86 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  30.09 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  34.08 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  30.18 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  32.71 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  36.97 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  30.67 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  25.47 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  28.88 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  26.24 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  34.85 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  29.58 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  34.45 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  32.82 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  29.09 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  27.11 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  34.09 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  32.2 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  29.25 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  33.58 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  28.35 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  25.73 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  25.24 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  25.24 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  21.94 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0591  hypothetical protein  54.55 
 
 		 45 aa  52  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.425982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  24.76 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  24.76 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  24.76 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  24.76 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  24.27 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  24.02 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  24.55 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  24.74 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  24.27 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  34.34 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  22.82 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  21.5 
 
 		 261 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  23.11 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  21.18 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  21.18 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  21.18 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1460  hypothetical protein  31.19 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  21.67 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  20.69 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>