More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3225 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
412 aa  860    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0731874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3224  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.32 
 
 
411 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.841797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2454  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.49 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486629  normal  0.341461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1358  Rieske (2Fe-2S) region  46.7 
 
 
451 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.7533999999999998e-22  hitchhiker  0.0000112258 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.26 
 
 
356 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.34 
 
 
347 aa  93.6  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  25.19 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.03 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.03 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.53 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  35.03 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.53 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  31.61 
 
 
355 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.04 
 
 
450 aa  87  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  29.95 
 
 
356 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.95 
 
 
356 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.64 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  44.88 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.64 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  32.26 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.47 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  42.06 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  31.02 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.02 
 
 
343 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.71 
 
 
357 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  30.68 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.89 
 
 
363 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  29.25 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  42.02 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.58 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.54 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.88 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.74 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  38.66 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  39.17 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.85 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.85 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.85 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.85 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.85 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.85 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.85 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  36.24 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.89 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  26.46 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.9 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.89 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  38.28 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.06 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  39.06 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.06 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.6 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  36.43 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.35 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.84 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  33.52 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  37.59 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.42 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  28.5 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.81 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.96 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.6 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  36.21 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  30.65 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  38.33 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  40.48 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  22.25 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  34.71 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  22.14 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  31.38 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  37.59 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.19 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.62 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.62 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  38.76 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.62 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.95 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.05 
 
 
364 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.22 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.73 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  39.5 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  27.59 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  39.06 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  34.78 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  31.61 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.06 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  21.95 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  29.51 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  28.37 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.23 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.72 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  25.93 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>