More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2868 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
439 aa  884    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
446 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  32.6 
 
 
453 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
446 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  27.61 
 
 
455 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
446 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  27.61 
 
 
455 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  31.1 
 
 
429 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  37.21 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  37.95 
 
 
480 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  35.69 
 
 
472 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
445 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
459 aa  177  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
446 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  36.24 
 
 
449 aa  177  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  35.35 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
459 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
429 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
455 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  34.31 
 
 
458 aa  169  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
446 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  30.35 
 
 
456 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
450 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
442 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  36.91 
 
 
381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  34.64 
 
 
449 aa  166  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
449 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  34.75 
 
 
458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  37.88 
 
 
412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  30.77 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
455 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
458 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
467 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  29.85 
 
 
449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
443 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
440 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
455 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
454 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
419 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  32.19 
 
 
453 aa  156  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
420 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  34.91 
 
 
449 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  33.43 
 
 
452 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  30.96 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.33 
 
 
471 aa  153  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  34.85 
 
 
445 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
444 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
457 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  27.11 
 
 
471 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  35.42 
 
 
416 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
466 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
449 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
469 aa  146  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  28.82 
 
 
465 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
478 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  31.85 
 
 
462 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
546 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
536 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
449 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  29.61 
 
 
457 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
471 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.94 
 
 
1162 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
717 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 
423 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  37.64 
 
 
473 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
464 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  32.4 
 
 
365 aa  136  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  37.27 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  29.93 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  30.84 
 
 
469 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
465 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  30.61 
 
 
436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
469 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  28.25 
 
 
458 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
406 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  34.33 
 
 
443 aa  133  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  26.96 
 
 
446 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
470 aa  132  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  33.33 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  31.39 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  32.74 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  27.81 
 
 
461 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  31.56 
 
 
468 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
487 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
467 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>