More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1090 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  54.5 
 
 		 555 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  55.04 
 
 		 555 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 555 aa  1146    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  53.71 
 
 		 563 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  53.42 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  55.1 
 
 		 560 aa  623  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  51.62 
 
 		 551 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  51.62 
 
 		 559 aa  599  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  51.01 
 
 		 566 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0284  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  49.09 
 
 		 553 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1154  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  48.28 
 
 		 598 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2935  AMP-binding domain-containing protein  48.46 
 
 		 553 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2780  AMP-binding domain-containing protein  48.28 
 
 		 598 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  47.19 
 
 		 546 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  45.8 
 
 		 559 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  43.3 
 
 		 546 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  43.71 
 
 		 551 aa  482  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  42.99 
 
 		 551 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  43.41 
 
 		 575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  43.01 
 
 		 555 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  42.57 
 
 		 554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 		 551 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  42.28 
 
 		 554 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  42.57 
 
 		 554 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  42.28 
 
 		 554 aa  465  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 551 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 		 554 aa  458  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.41 
 
 		 563 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  40.97 
 
 		 558 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  41.28 
 
 		 555 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 		 547 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 554 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.06 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.42 
 
 		 563 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  40.3 
 
 		 547 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  39.75 
 
 		 547 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  37.8 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  37.61 
 
 		 555 aa  392  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 607 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 620 aa  280  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 596 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  35.18 
 
 		 592 aa  279  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.85 
 
 		 597 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 597 aa  273  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.03 
 
 		 610 aa  273  9e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 610 aa  270  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.59 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 663 aa  270  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 590 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 630 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 616 aa  264  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 590 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 610 aa  264  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 602 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 600 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 599 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 609 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 601 aa  260  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 602 aa  260  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 609 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 607 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 599 aa  260  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 599 aa  260  6e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 592 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  31.21 
 
 		 587 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 596 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 622 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 600 aa  258  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  30.76 
 
 		 601 aa  257  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 592 aa  257  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 610 aa  257  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 633 aa  256  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.59 
 
 		 602 aa  256  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 608 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 593 aa  256  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 615 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 605 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 606 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 599 aa  253  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 599 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.78 
 
 		 606 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 609 aa  250  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 601 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  30.46 
 
 		 601 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  30.46 
 
 		 588 aa  249  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 596 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 		 614 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 592 aa  248  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 606 aa  246  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.41 
 
 		 598 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  28.23 
 
 		 604 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 602 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  30.44 
 
 		 602 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 602 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 602 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>