More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0663 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0663  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 151 aa  312  8e-85  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.131584  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl493  50S ribosomal protein L13  76.16 
 
 		 150 aa  246  7e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.363056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 145 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 145 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  160  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  49.31 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  49.31 
 
 		 150 aa  156  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  50.34 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  49.28 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  47.65 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  47.59 
 
 		 170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  46.85 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  46.53 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  51.47 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  45.95 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  46.58 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  46.15 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  46.58 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  48.55 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  46.15 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  49.31 
 
 		 147 aa  147  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 148 aa  147  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  49.26 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  47.52 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  47.55 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  45.95 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  47.18 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  47.55 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  48.28 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  46.43 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  46.43 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  46.53 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  44.22 
 
 		 151 aa  143  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 142 aa  143  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  47.79 
 
 		 154 aa  143  6e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  45.45 
 
 		 143 aa  144  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  48.18 
 
 		 144 aa  143  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  45.45 
 
 		 143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  46.85 
 
 		 142 aa  143  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  46.81 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  45.45 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  44.06 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  46.27 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  46.27 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  46.27 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  43.97 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  44.06 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  45.52 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  47.76 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  48.15 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  45.52 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  47.76 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3437  50S ribosomal protein L13  46.21 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  44.78 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  47.22 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  49.31 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>