More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00163 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  100 
 
 
507 aa  988    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.72 
 
 
541 aa  350  3e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.42 
 
 
540 aa  341  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 
545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
536 aa  326  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  44.65 
 
 
1057 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
530 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 
536 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
528 aa  259  9e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
523 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
530 aa  237  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
543 aa  211  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
515 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
512 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  38.37 
 
 
502 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
540 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
557 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
511 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  35.18 
 
 
515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
514 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
521 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
521 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
521 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  30.75 
 
 
541 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
536 aa  186  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.46 
 
 
521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  30.19 
 
 
541 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
550 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.47 
 
 
511 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
521 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.85 
 
 
567 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
518 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
509 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
526 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.46 
 
 
555 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.27 
 
 
530 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 
538 aa  173  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.65 
 
 
561 aa  173  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
538 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.27 
 
 
549 aa  170  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
522 aa  170  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.18 
 
 
531 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
530 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  28.98 
 
 
564 aa  166  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.4 
 
 
540 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
544 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
530 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 
544 aa  160  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  26.2 
 
 
533 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
526 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.4 
 
 
540 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
503 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
540 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
568 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
544 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
526 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
556 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
543 aa  157  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
543 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  31.4 
 
 
529 aa  153  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  29.85 
 
 
553 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
559 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  26.8 
 
 
555 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
543 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 
542 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
538 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.78 
 
 
538 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 
544 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
525 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 
539 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  29.81 
 
 
543 aa  149  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.6 
 
 
543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
525 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.26 
 
 
542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.8 
 
 
543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 
533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
534 aa  147  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
506 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.21 
 
 
562 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  31.14 
 
 
534 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
543 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 
543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  25.98 
 
 
518 aa  141  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 
541 aa  140  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.7 
 
 
554 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  30.25 
 
 
513 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.29 
 
 
570 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.01 
 
 
543 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
543 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
553 aa  137  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  28.39 
 
 
556 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  32.95 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.63 
 
 
550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  28.74 
 
 
559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>