More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4648 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4648  ankyrin  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  82.25 
 
 
176 aa  260  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  68.29 
 
 
200 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  68.29 
 
 
194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  67.68 
 
 
195 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  65.84 
 
 
192 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  58.28 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  59.64 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  57.67 
 
 
181 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  59.15 
 
 
178 aa  181  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  60 
 
 
175 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  59.06 
 
 
174 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  57.83 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  55.03 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  58.43 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  54.49 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  56.29 
 
 
171 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  59.21 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  59.21 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  55.09 
 
 
171 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  62.04 
 
 
170 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  50.92 
 
 
173 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  51.45 
 
 
190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  50 
 
 
125 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  50.74 
 
 
139 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  42.62 
 
 
172 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  49.61 
 
 
145 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  48.48 
 
 
130 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  48 
 
 
135 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  50 
 
 
136 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  45.24 
 
 
137 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  35.33 
 
 
197 aa  95.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  42.34 
 
 
185 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  44.88 
 
 
128 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  40.88 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  33.82 
 
 
156 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  39.29 
 
 
157 aa  91.3  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  40.88 
 
 
183 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  33.82 
 
 
156 aa  90.9  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  33.82 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  46.46 
 
 
132 aa  90.5  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  38.19 
 
 
155 aa  89  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  40.15 
 
 
201 aa  87.8  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  51.69 
 
 
140 aa  87.8  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  40 
 
 
155 aa  87.8  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  45.19 
 
 
149 aa  87  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  31.54 
 
 
162 aa  87  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  35.86 
 
 
189 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  35.04 
 
 
184 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  44.8 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  35.53 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  39.42 
 
 
203 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  38.64 
 
 
161 aa  84  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  44.95 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  36.6 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  46.49 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  37.16 
 
 
219 aa  80.9  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  34.64 
 
 
197 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  35.26 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  35.26 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  35.26 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  35.48 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  39.2 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  37.5 
 
 
223 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  36.8 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  32.89 
 
 
404 aa  77.4  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  41.59 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  37.3 
 
 
870 aa  76.3  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  39.67 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  39.5 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  39.5 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  38.1 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  39.5 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  35.56 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  39.5 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  39.5 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  39.5 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  39.5 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  35.42 
 
 
494 aa  74.7  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  38.1 
 
 
235 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  38.1 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  38.1 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  32.61 
 
 
855 aa  73.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1844  ankyrin  39.35 
 
 
619 aa  73.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  37.16 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  31.87 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  37.21 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 
1030 aa  72.4  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  37.61 
 
 
469 aa  72.4  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  35.04 
 
 
216 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  37.21 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  37.21 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  34.81 
 
 
185 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  33.1 
 
 
382 aa  72  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  34.81 
 
 
185 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  37.21 
 
 
236 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  33.33 
 
 
450 aa  71.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  34.97 
 
 
2171 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  36.52 
 
 
223 aa  70.9  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  42.75 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>