More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3451 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  100 
 
 		 578 aa  1127    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.9 
 
 		 290 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  82.97 
 
 		 298 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  70.42 
 
 		 288 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  75.09 
 
 		 292 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  74.7 
 
 		 291 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.08 
 
 		 300 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  77.54 
 
 		 279 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  77.02 
 
 		 286 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.9 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  77.59 
 
 		 276 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  70.03 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.38 
 
 		 311 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  75.74 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  75.74 
 
 		 313 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  75.74 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.67 
 
 		 287 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.32 
 
 		 287 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  75.74 
 
 		 332 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.32 
 
 		 287 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  70.04 
 
 		 276 aa  364  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  74.89 
 
 		 336 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  69.26 
 
 		 276 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.01 
 
 		 288 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  72.02 
 
 		 279 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  74.37 
 
 		 308 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.32 
 
 		 295 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.32 
 
 		 295 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  73.31 
 
 		 288 aa  359  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.32 
 
 		 295 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.61 
 
 		 287 aa  359  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.61 
 
 		 295 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  74.9 
 
 		 286 aa  357  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  74.18 
 
 		 282 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  71.25 
 
 		 284 aa  353  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  66.78 
 
 		 292 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  66.55 
 
 		 292 aa  350  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  70.87 
 
 		 313 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.87 
 
 		 295 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  71.21 
 
 		 276 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  71.21 
 
 		 276 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  71.21 
 
 		 276 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  71.21 
 
 		 276 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  71.21 
 
 		 276 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  74.26 
 
 		 287 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  73.84 
 
 		 287 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  73.84 
 
 		 287 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  68.91 
 
 		 278 aa  342  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  71.99 
 
 		 288 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  70.43 
 
 		 276 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  74.68 
 
 		 287 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.55 
 
 		 288 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.439861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.9 
 
 		 288 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  68.02 
 
 		 276 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  68.02 
 
 		 258 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  64.08 
 
 		 256 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  63.67 
 
 		 256 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  67.57 
 
 		 259 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  58.57 
 
 		 288 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  65.04 
 
 		 271 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.31 
 
 		 308 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.61 
 
 		 288 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  66.81 
 
 		 261 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  66.22 
 
 		 264 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  66.22 
 
 		 264 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.27 
 
 		 289 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  68.92 
 
 		 256 aa  310  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  64.16 
 
 		 272 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.36 
 
 		 298 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.36 
 
 		 298 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  59.25 
 
 		 289 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.66 
 
 		 254 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  60.17 
 
 		 292 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  56.73 
 
 		 298 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  61.54 
 
 		 323 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.5 
 
 		 292 aa  297  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  61.41 
 
 		 323 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  61.41 
 
 		 323 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.5 
 
 		 292 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  67.41 
 
 		 313 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  67.41 
 
 		 313 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  67.41 
 
 		 323 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  66.51 
 
 		 265 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  60.75 
 
 		 287 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.93 
 
 		 288 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  57.66 
 
 		 281 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.19 
 
 		 303 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  57.19 
 
 		 303 aa  278  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.4 
 
 		 294 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  57.87 
 
 		 271 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.2 
 
 		 296 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  59.83 
 
 		 265 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  51.88 
 
 		 282 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04668  permease  67.78 
 
 		 239 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.56 
 
 		 270 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  82.55 
 
 		 187 aa  246  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.35 
 
 		 295 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.39 
 
 		 257 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  56.5 
 
 		 264 aa  230  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>