65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1908 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  332  9e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  40 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  35.15 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  34.16 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  29.49 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  34.59 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.02 
 
 		 428 aa  79  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  35.96 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  29.13 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  32.2 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  30.53 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  24.2 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  30.66 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  26.09 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  30.33 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  30.47 
 
 		 489 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  25.15 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  28 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  25.32 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  25.32 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  27.16 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  29.32 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1795  flavodoxin  41.18 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000255293  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  27.97 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  25.84 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  25.15 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  25.64 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  26.15 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  23.14 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  24 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  26.5 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  27.03 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  20.27 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  28.3 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  31.36 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  26.4 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  24.27 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  23.28 
 
 		 173 aa  50.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  29.41 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  28.4 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  25.71 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  25.6 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  23.39 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  23.77 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  25.66 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  28.24 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  24.32 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  29.75 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  23.28 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  28.7 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  19.85 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  29.06 
 
 		 205 aa  44.3  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  27.91 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.89 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  25.98 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  30.59 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  29.55 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  30.59 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>