287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1660 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  42.29 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  37.5 
 
 
253 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  37.21 
 
 
253 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  35.86 
 
 
247 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  35.63 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  35.27 
 
 
255 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  37.65 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  37.65 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  37.65 
 
 
277 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  29.87 
 
 
256 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  30.74 
 
 
254 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  31.9 
 
 
251 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  28.57 
 
 
256 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
253 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  30.58 
 
 
264 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  32.76 
 
 
251 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  29.8 
 
 
253 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 
256 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  29.71 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  31.56 
 
 
251 aa  98.6  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  31.36 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  29.51 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  32.28 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  34.07 
 
 
249 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  31.76 
 
 
251 aa  95.5  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  29.48 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  29.48 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  31.69 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  29.46 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  30.6 
 
 
292 aa  92.4  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  34.45 
 
 
247 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  29.76 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  28.87 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  28.98 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  34.98 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  31.72 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 
247 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  29.88 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  29.11 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  28.88 
 
 
251 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  30.32 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  31.85 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  26.22 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  29.96 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  28.85 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  32 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  28.63 
 
 
251 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  29.25 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  28.97 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  28.74 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  27.24 
 
 
247 aa  79  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  26.5 
 
 
306 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  29.78 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  28.51 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  29.15 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  25.18 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  25.51 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  25.51 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  26.05 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  28.69 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  29.75 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  25.91 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  26.89 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  25.51 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  25.79 
 
 
252 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  25.91 
 
 
252 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  26.38 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  26.38 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  26.38 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  26.19 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  26.2 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  30.29 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  29.88 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  29.12 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  25.59 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  26.75 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  24.77 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  25.69 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  26.83 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  29.5 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  26.34 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  24.32 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  27.65 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  23.98 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  24.32 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  24.32 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  26.79 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  24.32 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  29.83 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>