More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0750 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  36.19 
 
 		 1065 aa  650    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  37.16 
 
 		 1165 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  38.76 
 
 		 1110 aa  783    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  38.86 
 
 		 1108 aa  785    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  38.99 
 
 		 1108 aa  788    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  38.32 
 
 		 1092 aa  710    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  36.64 
 
 		 1159 aa  648    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  35.88 
 
 		 1155 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  39.04 
 
 		 1108 aa  789    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  39.13 
 
 		 1108 aa  793    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  39.04 
 
 		 1108 aa  791    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  37.41 
 
 		 1173 aa  640    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  36.63 
 
 		 1174 aa  664    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  100 
 
 		 1115 aa  2291    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  37.48 
 
 		 1161 aa  666    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  36.71 
 
 		 1225 aa  697    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  38.2 
 
 		 1134 aa  732    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  37.5 
 
 		 1156 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  36.48 
 
 		 1159 aa  675    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  38.81 
 
 		 1109 aa  789    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  35.66 
 
 		 1155 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  37.35 
 
 		 1165 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  37.55 
 
 		 1151 aa  659    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  39.04 
 
 		 1108 aa  789    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  36.52 
 
 		 1127 aa  699    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  38.3 
 
 		 1139 aa  722    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  37.33 
 
 		 1156 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  34.97 
 
 		 1139 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  35.75 
 
 		 1157 aa  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  35.34 
 
 		 1186 aa  660    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.63 
 
 		 1122 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  36.45 
 
 		 1156 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  37.18 
 
 		 1145 aa  707    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  39.15 
 
 		 1104 aa  757    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  37.09 
 
 		 1175 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  38.86 
 
 		 1108 aa  787    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.94 
 
 		 1165 aa  639    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  37.87 
 
 		 1065 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  37.5 
 
 		 1179 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  36.15 
 
 		 1148 aa  690    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  35.55 
 
 		 1130 aa  651    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  36.37 
 
 		 1145 aa  711    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  37.27 
 
 		 1075 aa  683    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  38.86 
 
 		 1108 aa  788    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  44.79 
 
 		 1038 aa  831    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  43.93 
 
 		 1112 aa  914    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  35.4 
 
 		 1164 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  39.04 
 
 		 1108 aa  791    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  37.87 
 
 		 1065 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  36.43 
 
 		 1184 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  33.87 
 
 		 1181 aa  678    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  35.44 
 
 		 1149 aa  633  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  35.26 
 
 		 1132 aa  634  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  36.51 
 
 		 1160 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  35.83 
 
 		 1036 aa  632  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  35.53 
 
 		 1155 aa  629  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  33.48 
 
 		 1160 aa  626  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  33.59 
 
 		 1160 aa  625  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  33.59 
 
 		 1160 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  33.5 
 
 		 1160 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  33.59 
 
 		 1160 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  33.68 
 
 		 1160 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  33.7 
 
 		 1160 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  36.99 
 
 		 1139 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  33.96 
 
 		 1159 aa  624  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  33.59 
 
 		 1160 aa  625  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  33.68 
 
 		 1160 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  33.59 
 
 		 1160 aa  624  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1160 aa  625  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  33.59 
 
 		 1160 aa  624  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  33.59 
 
 		 1160 aa  624  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  35.07 
 
 		 1148 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  34.94 
 
 		 1148 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  36.03 
 
 		 1162 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  35.94 
 
 		 1185 aa  622  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  33.59 
 
 		 1160 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  34.55 
 
 		 1171 aa  618  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  35.63 
 
 		 1159 aa  619  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1161  DNA polymerase III subunit alpha  33.78 
 
 		 1174 aa  618  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0775975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  34.28 
 
 		 1165 aa  619  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  35.87 
 
 		 1151 aa  619  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0174  DNA polymerase III subunit alpha  35.1 
 
 		 1193 aa  617  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.224841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  35.17 
 
 		 1173 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  36.19 
 
 		 1168 aa  616  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  35.42 
 
 		 1170 aa  615  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  33.62 
 
 		 1174 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  34.64 
 
 		 1172 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  33.45 
 
 		 1160 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  35.05 
 
 		 1190 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  33.7 
 
 		 1174 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3345  DNA polymerase III subunit alpha  34.04 
 
 		 1160 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  34.73 
 
 		 1172 aa  615  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0956  DNA polymerase III subunit alpha  33.74 
 
 		 1160 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.582605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  36.02 
 
 		 1168 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  34.39 
 
 		 1182 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  34.31 
 
 		 1165 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  33.79 
 
 		 1185 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7295  DNA polymerase III, alpha subunit  36.89 
 
 		 1158 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  35.14 
 
 		 1182 aa  613  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  35.53 
 
 		 1179 aa  615  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>