More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4379 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4379  catalase  100 
 
 		 353 aa  715    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  48.96 
 
 		 338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  41.87 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  42.21 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  43.09 
 
 		 362 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  39.2 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  40.53 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  40.98 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  40.8 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  40.47 
 
 		 350 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  41.58 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  37.72 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  40.6 
 
 		 348 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  40.13 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  41.25 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  41.25 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  41.25 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  41.72 
 
 		 361 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  40.4 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  40 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  36.39 
 
 		 329 aa  219  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  40 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  40 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  39.87 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  40.67 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  40.2 
 
 		 363 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  39.87 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  37.63 
 
 		 365 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  37.63 
 
 		 351 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  38.59 
 
 		 353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  38.41 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  38.59 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  33.82 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  37.12 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  36.58 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  35.45 
 
 		 372 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  33.91 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  36.12 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  33.94 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  36.77 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  34.04 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  36.7 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  34.34 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  36.54 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  38.71 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  33.73 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  33.73 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  34.21 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  37.31 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  36.31 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  35.44 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  35.37 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  36.46 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  32.73 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  32.75 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  38.59 
 
 		 330 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  35.87 
 
 		 335 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  37.42 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  35.89 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  35.25 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  35.58 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  33.12 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  27.74 
 
 		 493 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  31.4 
 
 		 303 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  26.74 
 
 		 566 aa  109  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  27.94 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  27.24 
 
 		 506 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  27.24 
 
 		 506 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  27.12 
 
 		 529 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  26.51 
 
 		 529 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  25.71 
 
 		 504 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  26.17 
 
 		 529 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  27.05 
 
 		 498 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  23.87 
 
 		 505 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  25.98 
 
 		 478 aa  99.8  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  27.7 
 
 		 483 aa  99.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  25.64 
 
 		 527 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  25.35 
 
 		 481 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  26.03 
 
 		 493 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  26.88 
 
 		 493 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  26.28 
 
 		 504 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  26.26 
 
 		 704 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  27.08 
 
 		 695 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  27.34 
 
 		 716 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2662  catalase  27.36 
 
 		 486 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  27.55 
 
 		 511 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  27.61 
 
 		 712 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  27.55 
 
 		 511 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  25.98 
 
 		 486 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  27.55 
 
 		 511 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1236  Catalase  27.62 
 
 		 483 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0619868  normal  0.69126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  26.82 
 
 		 665 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  27.18 
 
 		 490 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  26.49 
 
 		 665 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  26.49 
 
 		 665 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  27.84 
 
 		 517 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  26.82 
 
 		 661 aa  96.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  26.94 
 
 		 491 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  26.38 
 
 		 688 aa  96.3  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  26.17 
 
 		 529 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>