More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3562 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  59.09 
 
 		 247 aa  245  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  55.09 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  54.39 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  53.31 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  52.97 
 
 		 248 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  53.97 
 
 		 299 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 249 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  54.59 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  50.22 
 
 		 256 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  54.59 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  48.76 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  52.29 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.09 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  52.29 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  49.08 
 
 		 249 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  51.17 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  49.09 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  50.46 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.66 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  52.29 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  49.35 
 
 		 254 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  50.44 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  55.05 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  48.86 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  47.93 
 
 		 232 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  50.46 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  49.54 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  49.55 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 245 aa  184  8e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  45.85 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  47.32 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  50.25 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  47.71 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  39.17 
 
 		 235 aa  178  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  47.69 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.45 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  38.91 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  43.81 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  46.4 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  45.32 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  40.72 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  42.11 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  40.79 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40.99 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  42.08 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  35.58 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.95 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  42.08 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  39.73 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  40.18 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  36.77 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.89 
 
 		 256 aa  151  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.83 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  32.65 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  38.16 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  40.27 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  38.74 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  41.95 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  32.65 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  39.65 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  45.5 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  41.18 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  39.91 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  37.56 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  32.42 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  34.23 
 
 		 273 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  38.94 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  38.22 
 
 		 262 aa  141  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  38.53 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  38.49 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  39.56 
 
 		 289 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  36.71 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  42.79 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.11 
 
 		 248 aa  138  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  39.64 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  34.53 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  39.64 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  38.46 
 
 		 273 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  36.61 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  33.48 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  30.74 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  32.74 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  40.09 
 
 		 259 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  36.61 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>