More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0712 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4275  hypothetical protein  57.38 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.13 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  45.33 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.21 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.21 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.43 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.94 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.16 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  45.33 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  45.58 
 
 		 326 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.47 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.22 
 
 		 331 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.65 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.49 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.63 
 
 		 356 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.57 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.28 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.94 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  40.84 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.88 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.72 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  43.64 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.82 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  41.43 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.85 
 
 		 333 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.51 
 
 		 322 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.35 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.56 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.05 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.67 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.13 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.47 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.32 
 
 		 320 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.58 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1884  hypothetical protein  44.52 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 348 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  40.8 
 
 		 353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  40.8 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.41 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  34.49 
 
 		 328 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  40.27 
 
 		 341 aa  222  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.16 
 
 		 330 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.4 
 
 		 334 aa  222  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.23 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.36 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.23 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.26 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  42.52 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  40.52 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  40.86 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  44.1 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  45.32 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  40.38 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.73 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  42 
 
 		 326 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.01 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.4 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.13 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.07 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.97 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.64 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  43.66 
 
 		 386 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.91 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  39.46 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.36 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.8 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.28 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.56 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.62 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.17 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  39.46 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.41 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.13 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.13 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.58 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1351  Fis family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  40.62 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.4 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  40.81 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  41.9 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.06 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  42.81 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  40.43 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.74 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.41 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.01 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  37.92 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.13 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  37.58 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.24 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  38.06 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5303  hypothetical protein  41.82 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123034  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  39.47 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  40.07 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>