More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0672 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  664    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  59.89 
 
 		 356 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  59.26 
 
 		 353 aa  339  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  51.58 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  51.58 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  51.86 
 
 		 356 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  48.72 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  49.28 
 
 		 358 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  51.29 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  50.72 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  45.35 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  42.53 
 
 		 665 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  39.88 
 
 		 329 aa  238  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  39.58 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  41.16 
 
 		 357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  41.09 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  39.47 
 
 		 357 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  41.98 
 
 		 363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  37.97 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  41.21 
 
 		 357 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  40.92 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  40.55 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  41.5 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  43.27 
 
 		 360 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  38.52 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  36.44 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  38.71 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  38.71 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  34.9 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  36.9 
 
 		 418 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  37.47 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  40.92 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  33.71 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  37.32 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  33.83 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  35.57 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  34.52 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  38.83 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  32.12 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  34.1 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  34.82 
 
 		 366 aa  169  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  31.55 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  43.31 
 
 		 368 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  36.47 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  29.11 
 
 		 379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  35.84 
 
 		 364 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  36.47 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  27.33 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  33.14 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  31.61 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  33.14 
 
 		 382 aa  159  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  33.13 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  35.96 
 
 		 398 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  33.04 
 
 		 374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  37.46 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  34.67 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  34.05 
 
 		 452 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  34.85 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  34.85 
 
 		 375 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  35.06 
 
 		 382 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  31.39 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  32.55 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  36.53 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  34.56 
 
 		 375 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  29.8 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  32.82 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  34.56 
 
 		 382 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  34.67 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  34.67 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.91 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  33.64 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  32.44 
 
 		 370 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  25.74 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  32.55 
 
 		 370 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  30.03 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  30.06 
 
 		 365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  27.62 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  27.62 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  27.62 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  27.62 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  27.62 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.3 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  27.81 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.81 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.81 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  25.89 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  32.45 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.46 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  28.12 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  28.21 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.55 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  29.14 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  30.16 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.36 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.71 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  27.3 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.62 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>