More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0282 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 448 aa  908    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 		 431 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  32.94 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  31.01 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  34.11 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  30.38 
 
 		 416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  30.31 
 
 		 419 aa  206  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  32.15 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  28.54 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 		 418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  28.84 
 
 		 421 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  27.58 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  28.27 
 
 		 420 aa  177  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  27.79 
 
 		 420 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  27.79 
 
 		 420 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 420 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 407 aa  166  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  25.47 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 		 401 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  30.24 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  31.04 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  27.96 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  25.76 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 		 413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 401 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  32.18 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  29.01 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  28.12 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  27.5 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  29.97 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.01 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  29.31 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 412 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  27.9 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  29.47 
 
 		 402 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  27.78 
 
 		 488 aa  133  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 401 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 		 377 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  27.3 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  26.2 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 		 398 aa  126  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  32.68 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  34.33 
 
 		 394 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 375 aa  124  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  31.71 
 
 		 405 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  35.08 
 
 		 394 aa  123  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.44 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  25.65 
 
 		 395 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 		 400 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 		 411 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 411 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  27.32 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  28.28 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 		 392 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  30.47 
 
 		 403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>