More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0153 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 351 aa  690    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  60.98 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  60.67 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  59.57 
 
 		 326 aa  361  9e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  59.27 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  60.43 
 
 		 331 aa  358  5e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  60.37 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  58.97 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  57.53 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  54.1 
 
 		 327 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  54.41 
 
 		 327 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  52.71 
 
 		 331 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  53.8 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  56.48 
 
 		 325 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  55.85 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  53.15 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  52.42 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  52.12 
 
 		 329 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  52.12 
 
 		 329 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  52.12 
 
 		 329 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  51.83 
 
 		 324 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  51.5 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  50.89 
 
 		 337 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  50.3 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  49.7 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  49.7 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  49.7 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  49.4 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  50.3 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  49.1 
 
 		 332 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  48.8 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  43.73 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  41.85 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  40.87 
 
 		 333 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  42.72 
 
 		 332 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  43.5 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  62.7 
 
 		 223 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  40.55 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  41.49 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  39.63 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  39.69 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  38.7 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  38.37 
 
 		 353 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  38.23 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  38.72 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  39.21 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  39.61 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  37.88 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  39.38 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  37.5 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  37.62 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  38.08 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  38.89 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  38.89 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  38.89 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  40.96 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  41.92 
 
 		 447 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  35.49 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  35.8 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  34.01 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  32.21 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  35.29 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  34.04 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  33.64 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.33 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  32.01 
 
 		 300 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  28.83 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.18 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.18 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  32.62 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 		 307 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  31.54 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 		 309 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  33.82 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 316 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 329 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.7 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  31.56 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.7 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  31.18 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  29.79 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  25.54 
 
 		 312 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  26.23 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  32.91 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  31.31 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>