90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0715 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0715  HerA helicase  100 
 
 
409 aa  822    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  27.65 
 
 
540 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  25.9 
 
 
574 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  26.68 
 
 
570 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  26.18 
 
 
600 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  26.87 
 
 
567 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  24.86 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  22.88 
 
 
617 aa  74.7  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  24.87 
 
 
628 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.1 
 
 
524 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.9 
 
 
508 aa  66.6  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  24.21 
 
 
603 aa  63.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  32.69 
 
 
679 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  25.88 
 
 
496 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  22.44 
 
 
500 aa  60.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  26.1 
 
 
492 aa  60.5  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.39 
 
 
557 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  21.88 
 
 
601 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  26.39 
 
 
559 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  23.61 
 
 
564 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  26.06 
 
 
674 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  23.79 
 
 
550 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  25.51 
 
 
546 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  22.41 
 
 
593 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  31.31 
 
 
510 aa  55.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  32.52 
 
 
544 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  22.34 
 
 
783 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  23.08 
 
 
664 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  20.91 
 
 
575 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  22.55 
 
 
584 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  32.85 
 
 
579 aa  54.7  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  24.22 
 
 
569 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  21.74 
 
 
626 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  27.48 
 
 
587 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  28.85 
 
 
709 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  28.68 
 
 
570 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  23.97 
 
 
591 aa  53.1  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  27.14 
 
 
595 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1466  hypothetical protein  28.45 
 
 
278 aa  53.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  22.61 
 
 
608 aa  52.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  27.85 
 
 
623 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  30.08 
 
 
526 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  28.77 
 
 
580 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  20.43 
 
 
693 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  35 
 
 
540 aa  49.7  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  32.5 
 
 
670 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  36.63 
 
 
532 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  33.61 
 
 
714 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  21.84 
 
 
617 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1476  hypothetical protein  30.77 
 
 
670 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.217881  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  27.4 
 
 
655 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  33.33 
 
 
599 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  25.62 
 
 
605 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  30 
 
 
557 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  29.31 
 
 
709 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  28.43 
 
 
579 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  28.09 
 
 
250 aa  47.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  24.66 
 
 
659 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  33 
 
 
530 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  26.71 
 
 
659 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  28.87 
 
 
734 aa  47.4  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  27.66 
 
 
531 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  20.75 
 
 
662 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  21 
 
 
583 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  24.17 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  26.98 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  23.4 
 
 
589 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.2 
 
 
496 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  26.96 
 
 
559 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  36.99 
 
 
569 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.21 
 
 
744 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  29.29 
 
 
497 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  30.3 
 
 
493 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  30.3 
 
 
497 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  30.3 
 
 
497 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  36 
 
 
546 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  26.5 
 
 
537 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  36.62 
 
 
560 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  35.38 
 
 
520 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  43.75 
 
 
686 aa  43.9  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5547  cell division FtsK/SpoIIIE  35.59 
 
 
920 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.101164 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5949  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.59 
 
 
920 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.691674  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  22.03 
 
 
628 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0050  hypothetical protein  27.48 
 
 
450 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.620647  normal  0.225924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  30 
 
 
577 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  38.3 
 
 
605 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  21.71 
 
 
582 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  25.74 
 
 
595 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1991  phage integrase family protein  25.68 
 
 
358 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0010  AAA family ATPase  27.48 
 
 
450 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>