More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0577 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0577  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113585  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1666  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  62.38 
 
 
213 aa  275  3e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  54.63 
 
 
216 aa  232  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0359  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.21 
 
 
215 aa  215  5e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000171313  hitchhiker  0.000153008 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0906  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.78 
 
 
209 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00296617  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0948  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
209 aa  203  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0793673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  47.17 
 
 
240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  48.08 
 
 
242 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  48.56 
 
 
242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  43.6 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  46.08 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  46.63 
 
 
246 aa  195  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  44.76 
 
 
252 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 
244 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  44.17 
 
 
244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  46.15 
 
 
249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  46.6 
 
 
241 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.06 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  48.06 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  48.06 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.06 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  46.41 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
242 aa  194  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
240 aa  194  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  47.12 
 
 
244 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  45.97 
 
 
240 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  44.93 
 
 
259 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
242 aa  193  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  44.02 
 
 
242 aa  193  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  47.09 
 
 
240 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
256 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  45.41 
 
 
240 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
240 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
240 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  44.93 
 
 
247 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1533  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 
230 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0016393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 
241 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  44.98 
 
 
244 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  45.71 
 
 
242 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  46.6 
 
 
241 aa  191  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  46.6 
 
 
241 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 
240 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
240 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
240 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 
240 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  44.98 
 
 
243 aa  191  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  45.15 
 
 
241 aa  191  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
240 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  45.37 
 
 
246 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
240 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
240 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  46.15 
 
 
247 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
240 aa  190  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 
247 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  47.09 
 
 
242 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
240 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1326  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 
224 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00202855  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  46.12 
 
 
241 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  48.06 
 
 
243 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
248 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  44.29 
 
 
250 aa  190  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.51 
 
 
506 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  42.51 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  42.03 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 
240 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  46.6 
 
 
241 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  44.23 
 
 
240 aa  188  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 
257 aa  188  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  44.23 
 
 
240 aa  188  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  43.75 
 
 
254 aa  188  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.76 
 
 
240 aa  188  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  47.52 
 
 
246 aa  188  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  46.38 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  43 
 
 
244 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  45.15 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
242 aa  187  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 
242 aa  188  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  43 
 
 
241 aa  187  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  47.52 
 
 
258 aa  188  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  45.37 
 
 
253 aa  187  8e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  44.81 
 
 
263 aa  187  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  42.58 
 
 
240 aa  187  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  44.76 
 
 
242 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  44.76 
 
 
242 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  42.59 
 
 
257 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  43.96 
 
 
240 aa  186  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  45.1 
 
 
252 aa  187  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
242 aa  187  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  46.12 
 
 
241 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  46.6 
 
 
241 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  43.54 
 
 
240 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.12 
 
 
244 aa  187  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  42.23 
 
 
253 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  45.15 
 
 
242 aa  186  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  45.71 
 
 
246 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  42.23 
 
 
243 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>