More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2061 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  56.25 
 
 		 227 aa  264  8e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  53.81 
 
 		 224 aa  256  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  51.13 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  47.51 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  49.32 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  49.32 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  47.95 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  48.86 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  47.95 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  47.95 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  47.95 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  47.49 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  47.49 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  47.49 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  47.03 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  47.49 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  47.49 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  44.89 
 
 		 224 aa  204  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  40.62 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.12 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  38.22 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  35.09 
 
 		 244 aa  158  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  38.67 
 
 		 236 aa  157  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  39.46 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  37.39 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  36.89 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.18 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  37.89 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.04 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  38.22 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  36.16 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  42.05 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  32.65 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  37.55 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  39.3 
 
 		 222 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  33.19 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  36.89 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  35.56 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  36.5 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  33.99 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  36.4 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  39.22 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  35.75 
 
 		 271 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  37.09 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  34.53 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  36 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  36 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  33.63 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  36.45 
 
 		 226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  37.84 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  35.91 
 
 		 262 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  34.5 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  33.48 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  37.61 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  33.63 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  37.16 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  38.33 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  34.55 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  33.33 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  37.27 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  34.36 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  33.92 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  39.8 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  40.3 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  35.78 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  33.48 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  33.48 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  35.4 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  33.48 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  35.29 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  34.07 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  35.43 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  34.22 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  32.74 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  36.44 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  35.87 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  35 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  33.78 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  34.07 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  35.84 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  33.63 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  37 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  33.19 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  30.94 
 
 		 257 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  37.67 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  31.56 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  29.65 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  32.91 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  35.09 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  35.84 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0452  alanine racemase domain protein  34.62 
 
 		 258 aa  125  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  33.48 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  35.84 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  32.59 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  35.4 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  33.63 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  32 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>