More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1860 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  64.13 
 
 		 226 aa  278  3e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  64.13 
 
 		 227 aa  269  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  55.4 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  228  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  53.99 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  53.05 
 
 		 225 aa  224  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  53.55 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  52.11 
 
 		 230 aa  201  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  48.36 
 
 		 219 aa  201  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  48.36 
 
 		 219 aa  201  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  52.09 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  49.53 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  52.63 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  46.92 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  50.68 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  47.71 
 
 		 227 aa  184  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 252 aa  181  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  45.71 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  46.76 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.15 
 
 		 534 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.26 
 
 		 528 aa  178  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  45.78 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  46.41 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  45.67 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.48 
 
 		 529 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  48.6 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.38 
 
 		 511 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.93 
 
 		 488 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.89 
 
 		 511 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.19 
 
 		 527 aa  170  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 539 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.13 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  41.9 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  43.13 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  40 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 514 aa  166  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.79 
 
 		 673 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.18 
 
 		 705 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.31 
 
 		 673 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  42.22 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.11 
 
 		 679 aa  165  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  37.85 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.08 
 
 		 510 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 233 aa  164  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.02 
 
 		 516 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  39.74 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  40.67 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.31 
 
 		 480 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  40.48 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  40.48 
 
 		 230 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  40.48 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  38.39 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  41.06 
 
 		 231 aa  161  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  40 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.9 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  43.54 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  42.54 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.54 
 
 		 516 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>