More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0766 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0766  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 335 aa  681    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3312  LacI family transcription regulator  32.09 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  32.31 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4691  transcriptional regulator, LacI family  26.88 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  28.3 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0808  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15090  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  26.57 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  25.8 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  26.09 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  25.62 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  24.31 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.53 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.09 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  25.57 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  28.9 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4446  transcriptional regulator, LacI family  24.32 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.4 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  25.22 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.4 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.4 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.4 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.4 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  24.64 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  26.8 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3158  transcriptional regulator, LacI family  26.09 
 
 		 348 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.41 
 
 		 335 aa  89  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.3 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  26.54 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  24.78 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  25.3 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  24.93 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  26.35 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  25.3 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  24.71 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.76 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  25.08 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  22.82 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.35 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.35 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  23.98 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  23.98 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  25.42 
 
 		 351 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  23.98 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  23.98 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  23.98 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  24.65 
 
 		 352 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  23.98 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  26.48 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  23.98 
 
 		 335 aa  86.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  23.97 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  23.97 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5609  transcriptional regulator, LacI family  26.21 
 
 		 335 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.918493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  25 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13230  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  24.1 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1250  LacI family transcription regulator  25.47 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  25.59 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.48 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1286  LacI family transcription regulator  25.93 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000013505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  25.42 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  26.57 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6160  transcriptional regulator, LacI family  27.95 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  24.65 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  26.99 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  25.99 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0256  regulatory protein, LacI  25.99 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0262  regulatory protein LacI  25.99 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  25.51 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  26.67 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  26.97 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  27.83 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  25.24 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3448  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.832183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  24.93 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  25.4 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.11 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5093  transcriptional regulator, LacI family  25.57 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1738  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.274916  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4604  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.39 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  26.05 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2243  LacI family transcription regulator  24.78 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  23.6 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0698  LacI family transcription regulator  24.93 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  25.28 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  24.02 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  26.14 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  25.77 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  25.77 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  23.15 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  26.03 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.71 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  25.21 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26870  transcriptional regulator PtxS  22.64 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  23.01 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.71 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>