More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0534 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  100 
 
 		 381 aa  786    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  66.58 
 
 		 381 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  65.88 
 
 		 381 aa  530  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  52.76 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  53.68 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  48.95 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  47.49 
 
 		 380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  46.44 
 
 		 380 aa  345  8e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  46.17 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  45.91 
 
 		 380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  45.91 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  45.91 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  45.91 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  45.91 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  45.91 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  45.91 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  45.91 
 
 		 380 aa  338  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  46.72 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  43.12 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  39.79 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.84 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  41.36 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  40.9 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  40.37 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.58 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.58 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  38.6 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  37.63 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.48 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  35.43 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  41.44 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  37.11 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  37.53 
 
 		 394 aa  263  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  37.63 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  40.73 
 
 		 392 aa  262  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  40.05 
 
 		 394 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  38.46 
 
 		 382 aa  259  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  37.63 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  40.22 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.21 
 
 		 400 aa  259  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  40.22 
 
 		 381 aa  258  9e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  36.05 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  37.86 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  37.02 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1280  aminotransferase, class V  37.27 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0012721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.64 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  38.17 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  36.98 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  40.11 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  37.47 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  37.23 
 
 		 387 aa  252  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1261  Cysteine desulfurase  39.26 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0457777  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  35.6 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  34.82 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  34.82 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  35.51 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  35.36 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.75 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  37.27 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.56 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  37.7 
 
 		 373 aa  245  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1772  aminotransferase, class V  36.24 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1807  aminotransferase class V  36.24 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  36.63 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.02 
 
 		 402 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  38.52 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  37.7 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  36.48 
 
 		 409 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  37.63 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  38.52 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  35 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  37.99 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  37.27 
 
 		 389 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  38.7 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  35.7 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  39.55 
 
 		 383 aa  239  8e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  37.37 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  36.39 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  35.96 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.6 
 
 		 398 aa  235  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  34.99 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  37.83 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  35.25 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  35.19 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  39.1 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  37.83 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  37.87 
 
 		 1135 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  34.74 
 
 		 407 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  38.44 
 
 		 385 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  35.25 
 
 		 388 aa  232  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  36.65 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  36.81 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  35.51 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  36.41 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  37 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  37 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  37.94 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.16 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>