More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0366 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0366  ABC-type metal ion transport system, permease component  100 
 
 
231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0427  ABC-type metal ion transport system, permease component  71 
 
 
231 aa  291  6e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1721  ABC-type metal ion transport system, permease component  58.7 
 
 
232 aa  274  9e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.02 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.799852  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0846  ABC-type metal ion transport system, permease component  64.94 
 
 
233 aa  228  9e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883508  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  54.02 
 
 
228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0343  ABC-type metal ion transport system, permease component  55.41 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000324678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1638  ABC transporter, permease protein  59.31 
 
 
230 aa  195  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  48.77 
 
 
226 aa  180  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  49.75 
 
 
225 aa  177  9e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
225 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0275  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 
221 aa  164  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 
222 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
226 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  52.71 
 
 
217 aa  158  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 
225 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  44.78 
 
 
224 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  44.28 
 
 
224 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  44.78 
 
 
213 aa  153  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
226 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
217 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  40.78 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  42.93 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
227 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
227 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.14 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
217 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
226 aa  144  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  39.9 
 
 
225 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
236 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
215 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
217 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
227 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
221 aa  141  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 
221 aa  141  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  47.32 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  43.56 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 
217 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 
217 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0643  ABC transporter, permease protein  40.44 
 
 
221 aa  137  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.766537  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  45.32 
 
 
217 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
223 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  48.54 
 
 
219 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
217 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
217 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
217 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.89 
 
 
227 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
217 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  45.32 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
224 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  42.36 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19580  ABC-type metal ion transport system, permease component  42 
 
 
222 aa  135  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846519 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 
217 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  41.09 
 
 
218 aa  134  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 
217 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 
218 aa  134  9e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 
217 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 
217 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  44.83 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1239  ABC transporter, permease protein  44.16 
 
 
303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0864  ABC transporter, permease protein  44.16 
 
 
303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.586541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2337  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.87 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790204  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0697  metal ion ABC transporter permease  42.79 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0794  ABC transporter, permease protein  44.16 
 
 
303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.485222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1797  hypothetical protein  44.55 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1798  hypothetical protein  44.55 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1534  D-methionine ABC transporter, permease  42.36 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145987  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
224 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
217 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
226 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  43.26 
 
 
218 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
223 aa  131  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0696244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 
228 aa  131  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3249  hypothetical protein  45.89 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  41.55 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.09 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0134414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  44.71 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  44.71 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
221 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  44.66 
 
 
218 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
224 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  44.66 
 
 
218 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  44.66 
 
 
218 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
224 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  44.66 
 
 
218 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>