More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0697 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0697  metal ion ABC transporter permease  100 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04700  ABC-type metal ion transport system, permease component  57.34 
 
 		 219 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.72 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.99 
 
 		 220 aa  221  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.2 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.99 
 
 		 218 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.82 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4961  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 221 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.45 
 
 		 221 aa  197  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23480  ABC-type metal ion transport system, permease component  61.19 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000057821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0342  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0298  ABC transporter permease  51.36 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0285  ABC transporter, permease  51.36 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0386  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0313  ABC transporter permease  51.36 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0344  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0282  ABC transporter, permease  50.91 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.14 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0359  ABC transporter, permease protein  53 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.19 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  42.66 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  44.8 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  45.83 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  50.28 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.75 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  41.1 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000207474  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000249965  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  43.06 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  40.54 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.4 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  40.99 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  40.55 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  40.55 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  40.55 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  40.55 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.16 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  43.14 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.14 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  41.98 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19580  ABC-type metal ion transport system, permease component  40.38 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  43.56 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.96 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  43.6 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  43.6 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0195  ABC transporter, permease protein  40.09 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00533098  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.799852  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  39.32 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  42.38 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  40.55 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0366  ABC-type metal ion transport system, permease component  42.79 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  40.09 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5128  ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  41.23 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  41.23 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  41.23 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  41.23 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0775  ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 		 220 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  46.41 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0674799  normal  0.269155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>