More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_23480  ABC-type metal ion transport system, permease component  100 
 
 
220 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000057821  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.55 
 
 
220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0697  metal ion ABC transporter permease  61.19 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.36 
 
 
218 aa  252  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.56 
 
 
230 aa  244  6.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.18 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04700  ABC-type metal ion transport system, permease component  60.55 
 
 
219 aa  234  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55 
 
 
221 aa  207  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.62 
 
 
221 aa  207  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.29 
 
 
230 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0298  ABC transporter permease  55.91 
 
 
221 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0285  ABC transporter, permease  55.91 
 
 
221 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0313  ABC transporter permease  55.91 
 
 
221 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0386  ABC transporter, permease protein  55.91 
 
 
221 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0344  ABC transporter, permease protein  55.91 
 
 
221 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.45 
 
 
221 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4961  ABC transporter, permease protein  55.45 
 
 
221 aa  205  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0342  ABC transporter, permease protein  55.45 
 
 
221 aa  204  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0282  ABC transporter, permease  55.45 
 
 
221 aa  203  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.11 
 
 
222 aa  188  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0359  ABC transporter, permease protein  56.28 
 
 
200 aa  185  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  48.15 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  47.69 
 
 
224 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 
224 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  42.65 
 
 
226 aa  157  9e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.51 
 
 
225 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  44.5 
 
 
225 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  49.28 
 
 
219 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  44.09 
 
 
225 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.28 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000207474  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.09 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  42.47 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.28 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000249965  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.5 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
222 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
222 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
236 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 
228 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  42.13 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  43.41 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
219 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  44.08 
 
 
218 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  44.08 
 
 
218 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  44.08 
 
 
218 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  44.08 
 
 
218 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  44.08 
 
 
218 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  44.08 
 
 
218 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
224 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0620  ABC transporter integral membrane protein  45.12 
 
 
219 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
220 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0559  ABC transporter integral membrane protein  45.12 
 
 
219 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
215 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
219 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0576  ABC transporter integral membrane protein  45.12 
 
 
219 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.332702 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
223 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0566  ABC transporter integral membrane protein  45.12 
 
 
219 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0561  ABC transporter integral membrane protein  45.12 
 
 
219 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
219 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  43.14 
 
 
225 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
217 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  49.02 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.12 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.250327  normal  0.570083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 
219 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
218 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 
221 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
222 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
229 aa  131  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.799852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 
217 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  36.79 
 
 
228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  46.04 
 
 
218 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.530157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  44.06 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
221 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  39.91 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  39.91 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19580  ABC-type metal ion transport system, permease component  39.25 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>