More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0422 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
222 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0282  ABC transporter, permease  55.09 
 
 
221 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0342  ABC transporter, permease protein  54.63 
 
 
221 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0386  ABC transporter, permease protein  54.63 
 
 
221 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0298  ABC transporter permease  54.63 
 
 
221 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0285  ABC transporter, permease  54.63 
 
 
221 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0313  ABC transporter permease  54.63 
 
 
221 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0344  ABC transporter, permease protein  54.63 
 
 
221 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 
221 aa  201  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 
221 aa  201  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4961  ABC transporter, permease protein  53.99 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.05 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0359  ABC transporter, permease protein  55.67 
 
 
200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0697  metal ion ABC transporter permease  43.52 
 
 
228 aa  173  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.66 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04700  ABC-type metal ion transport system, permease component  47.42 
 
 
219 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  54.49 
 
 
219 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  49.19 
 
 
224 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.77 
 
 
218 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23480  ABC-type metal ion transport system, permease component  52.11 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000057821  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 
219 aa  154  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000207474  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 
219 aa  154  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000249965  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  48.63 
 
 
224 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
223 aa  154  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.63 
 
 
224 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.89 
 
 
220 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  48.11 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  48.11 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  48.11 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
225 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  48.11 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  48.11 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  48.11 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 
221 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.1 
 
 
224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  47.39 
 
 
218 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 
218 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.31 
 
 
223 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 
228 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
217 aa  148  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.06 
 
 
221 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  46.12 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.12 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.06 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.34 
 
 
218 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 
224 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
217 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
221 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
224 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.34 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.34 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 
215 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
216 aa  141  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.530157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  49.03 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19580  ABC-type metal ion transport system, permease component  44.08 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
218 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
230 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
218 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.5 
 
 
221 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
218 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
217 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
217 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
217 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
221 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
217 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.43 
 
 
214 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  43.41 
 
 
217 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
227 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  43.41 
 
 
217 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
213 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  48.78 
 
 
216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
225 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  44.17 
 
 
217 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
217 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  42.57 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  45.69 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.8 
 
 
221 aa  134  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  47.74 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0775  ABC transporter, permease protein  36.41 
 
 
220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200655  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  40.39 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.77 
 
 
230 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
221 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  42.08 
 
 
225 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>