More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2300 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
218 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.05 
 
 
220 aa  256  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04700  ABC-type metal ion transport system, permease component  63.59 
 
 
219 aa  231  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0697  metal ion ABC transporter permease  58.99 
 
 
228 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.83 
 
 
230 aa  226  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.29 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23480  ABC-type metal ion transport system, permease component  66.36 
 
 
220 aa  215  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000057821  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.56 
 
 
221 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.38 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0386  ABC transporter, permease protein  55.76 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0298  ABC transporter permease  55.76 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0285  ABC transporter, permease  55.76 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0313  ABC transporter permease  55.76 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0344  ABC transporter, permease protein  55.76 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0342  ABC transporter, permease protein  55.3 
 
 
221 aa  198  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.84 
 
 
221 aa  198  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4961  ABC transporter, permease protein  54.84 
 
 
221 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0282  ABC transporter, permease  55.3 
 
 
221 aa  197  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0359  ABC transporter, permease protein  58.66 
 
 
200 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.61 
 
 
230 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.77 
 
 
222 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  47.22 
 
 
224 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  47.22 
 
 
224 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
225 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.22 
 
 
224 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
226 aa  148  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
222 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.6 
 
 
219 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 
224 aa  141  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  47.17 
 
 
219 aa  141  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.89 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000249965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.89 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000207474  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  42.2 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  41.47 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.91 
 
 
218 aa  138  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  46.91 
 
 
218 aa  138  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
215 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.09 
 
 
220 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
222 aa  131  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
220 aa  128  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  42.65 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 
213 aa  128  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  44.06 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  45.05 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  46.48 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
221 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
217 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
217 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  41.75 
 
 
218 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 
218 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 
218 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  41.75 
 
 
218 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  41.75 
 
 
218 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  41.75 
 
 
218 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
227 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
221 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
221 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
221 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  41.71 
 
 
213 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46 
 
 
221 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
223 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.250327  normal  0.570083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
221 aa  121  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
229 aa  121  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.799852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.96 
 
 
219 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
216 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.530157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  38.71 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0775  ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 
220 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200655  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0566  ABC transporter integral membrane protein  43.96 
 
 
219 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0561  ABC transporter integral membrane protein  43.96 
 
 
219 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0620  ABC transporter integral membrane protein  43.96 
 
 
219 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0576  ABC transporter integral membrane protein  43.96 
 
 
219 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.332702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  43.81 
 
 
217 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
218 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 
218 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0559  ABC transporter integral membrane protein  43.96 
 
 
219 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384603  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
235 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  41.29 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>