More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3599 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 470 aa  910    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  65.46 
 
 		 470 aa  618  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  62.61 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  57.51 
 
 		 468 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 479 aa  289  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.71 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  42.99 
 
 		 453 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.44 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  40.37 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 478 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  38.26 
 
 		 461 aa  246  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  41.95 
 
 		 422 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 498 aa  171  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.5 
 
 		 490 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.22 
 
 		 517 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2320  regulatory protein GntR HTH  32.5 
 
 		 464 aa  160  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303874  normal  0.360666 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2596  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.5 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 479 aa  156  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 395 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  31.24 
 
 		 478 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 481 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  23 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2275  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.44 
 
 		 464 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  24.3 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 547 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 473 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  23.53 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  25.44 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 554 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  23.46 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1335  GntR family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  22.25 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.33 
 
 		 468 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.34 
 
 		 470 aa  146  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 386 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  23.09 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  23.25 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1890  transcriptional regulator  32.83 
 
 		 488 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3062  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3084  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.189557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.57 
 
 		 484 aa  144  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.31 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7210  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.95 
 
 		 478 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  26.68 
 
 		 397 aa  144  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  24.12 
 
 		 480 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.9 
 
 		 475 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 487 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  24.4 
 
 		 480 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 476 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  24.61 
 
 		 480 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  29.32 
 
 		 393 aa  143  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2948  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216869  normal  0.403502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 611 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.43 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  29.32 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  29.04 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  29.32 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  29.23 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0204  GntR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  29 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4836  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal  0.780725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 393 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2733  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 430 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>