More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2464 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 129 aa  259  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  68.18 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  47.9 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  49.14 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  46.55 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  43.8 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  49.53 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  44.33 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  36.28 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  36.28 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  43.37 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  31.11 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  31.11 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  32.63 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  38.37 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  34.88 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  38.04 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  32.99 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  29.29 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  28.32 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  46.43 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  37.72 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  43.01 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.24 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  40.23 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0892  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  31.03 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  33.08 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  33.96 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5228  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 231 aa  53.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  31.93 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>