More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1344 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1344  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  266  8e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  39.83 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  57.14 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  50.77 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1121  hypothetical protein  49.11 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.38 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  38.78 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  53.97 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1825  secretory protein  59.42 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0661752  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.61 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.13 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  29.57 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  33.73 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  33.75 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  36.26 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  39.6 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  39.19 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  39.19 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  39.19 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  39.19 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  35.8 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  35.24 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3012  hypothetical protein  32.11 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  39.47 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  44.71 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  37.84 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  46.15 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  41.77 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  34.15 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  35.8 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  46.15 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  31.87 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  37.84 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  37.84 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3025  secretory protein  54.41 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  37.84 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.27 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1318  secretory protein  39.67 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.011576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  31.87 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  32.29 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  40.62 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.12 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  46.77 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  35.53 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  30.33 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  26.81 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  34.95 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  31.97 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.12 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  37.68 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  37.66 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.19 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  31.97 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.35 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  38.36 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  39.76 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  32.89 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  35.14 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  44.78 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  26.53 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  39.39 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.31 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  48.48 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  34.15 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  40.85 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.84 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  33.71 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  33.91 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  40.23 
 
 		 213 aa  57  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.35 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  43.06 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.92 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  34.62 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  34.67 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  41.94 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  37.33 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>