211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0496 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0496  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 539 aa  1088    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.906538 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2755  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  66.92 
 
 		 538 aa  701    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  decreased coverage  0.00000370584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0401  carbohydrate kinase FGGY  64.12 
 
 		 537 aa  628  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0242  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  60.71 
 
 		 531 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1145  carbohydrate kinase FGGY  55.03 
 
 		 532 aa  617  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3468  carbohydrate kinase FGGY  52.18 
 
 		 535 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29500  pentulose/hexulose kinase  54.1 
 
 		 546 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1020  putative L-ribulokinase  53.01 
 
 		 548 aa  541  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0854  L-ribulokinase (putative)  49.06 
 
 		 539 aa  541  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0480  carbohydrate kinase, FGGY  50.66 
 
 		 540 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.50905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0227  L-ribulokinase (putative)  49.81 
 
 		 532 aa  535  1e-151  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0034  sugar kinase  48.28 
 
 		 530 aa  510  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42527  predicted protein  28.86 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000294856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  25.7 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  26.36 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  25.05 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  25.44 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  24.95 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.64 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  23.57 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  25.94 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  22.6 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  29.62 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4109  carbohydrate kinase FGGY  26.02 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.32 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  21.46 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  28.02 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25.64 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  24.62 
 
 		 498 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  22.11 
 
 		 510 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  26.16 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  27.05 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  23.61 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  27.05 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  27.05 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  23.43 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  28.78 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  28.02 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  25.33 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  28.02 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  28.02 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  28.12 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  26.83 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  22.56 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  24.91 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  25.42 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  26.3 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  26.3 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  28.87 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  26.3 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  26.21 
 
 		 485 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  24.61 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  28.85 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  26.69 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  23.76 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  27.08 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  28.68 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  28.87 
 
 		 492 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  25.33 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  25.33 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  27.84 
 
 		 492 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  28.87 
 
 		 492 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.66 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  25.81 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  28.02 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  24.43 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  26.34 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  28.02 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  25.81 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  28.02 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  28.02 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  22.31 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  26.64 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  26.64 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  26.87 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  25.52 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  25.81 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  25.81 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  23.63 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  29 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  24.67 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  25.73 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  22.04 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  24.88 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  25 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  23.13 
 
 		 503 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  24.15 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  23.38 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  25.6 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  25.58 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  26.74 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  23.92 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  25.58 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  25.58 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  25 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0409  glycerol kinase  21.81 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  24.5 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  25.98 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  24.67 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  27.07 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>