More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0228 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0228  ABC transporter related  100 
 
 
324 aa  649    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00487637  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.84 
 
 
320 aa  354  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 
368 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0435  ABC transporter related  37.97 
 
 
328 aa  208  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.490211  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.63 
 
 
330 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.35 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  41.7 
 
 
332 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  45.92 
 
 
257 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  41 
 
 
303 aa  185  8e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  38.5 
 
 
243 aa  178  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  38.5 
 
 
243 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  41.72 
 
 
301 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
266 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  41.59 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  41.94 
 
 
282 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.07 
 
 
316 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.48 
 
 
316 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0903  ABC transporter related  43.43 
 
 
303 aa  168  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  35.95 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  38.02 
 
 
326 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  35.52 
 
 
319 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.34 
 
 
309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.47 
 
 
324 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  34.36 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0010  ABC transporter related  45.07 
 
 
339 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.83 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.93 
 
 
337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.59 
 
 
334 aa  162  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.82 
 
 
312 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  34.98 
 
 
314 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  38.6 
 
 
252 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
330 aa  162  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  36.14 
 
 
320 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.3 
 
 
312 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  34.45 
 
 
241 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 
331 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
311 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.03 
 
 
311 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40.67 
 
 
309 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  44.71 
 
 
3786 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  43.41 
 
 
303 aa  159  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  40.76 
 
 
334 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  39.15 
 
 
305 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.57 
 
 
318 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  40.36 
 
 
247 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 
321 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.88 
 
 
325 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  36.77 
 
 
250 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  41 
 
 
279 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  39.61 
 
 
301 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43 
 
 
338 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.57 
 
 
362 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  40.78 
 
 
318 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.44 
 
 
332 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  37.75 
 
 
329 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  40.78 
 
 
318 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  35.25 
 
 
293 aa  156  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  39.81 
 
 
338 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 
360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  37.76 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  33.97 
 
 
301 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  42.58 
 
 
300 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
356 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 
307 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  32.55 
 
 
312 aa  155  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  36.36 
 
 
312 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  41.29 
 
 
312 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 
324 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  39.71 
 
 
240 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  40.38 
 
 
316 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.94 
 
 
317 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  39.01 
 
 
247 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  31.11 
 
 
303 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  32.48 
 
 
306 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  36.75 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  43.46 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  33.07 
 
 
310 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  34.35 
 
 
326 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  39.32 
 
 
325 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
230 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  37.56 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  43 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.64 
 
 
328 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  42.93 
 
 
309 aa  152  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.07 
 
 
327 aa  152  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  38.27 
 
 
290 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 
324 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  33.8 
 
 
328 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.67 
 
 
319 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  41.18 
 
 
309 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 
307 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
309 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
309 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 
318 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  33.01 
 
 
298 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.84 
 
 
343 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  43.37 
 
 
323 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>