More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3081 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  100 
 
 		 675 aa  1365    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  40.82 
 
 		 669 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  40.37 
 
 		 657 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  36.52 
 
 		 791 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  35.38 
 
 		 668 aa  405  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  35.06 
 
 		 658 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  33.59 
 
 		 659 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  33.79 
 
 		 659 aa  379  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  34.31 
 
 		 659 aa  361  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0032  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  35.46 
 
 		 729 aa  349  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2114  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  36.4 
 
 		 726 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0490286  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0582  dehydrogenase E1 component  35.82 
 
 		 714 aa  347  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0029  putative acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit  35.16 
 
 		 729 aa  344  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0851607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3319  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  34.08 
 
 		 724 aa  343  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163319  hitchhiker  0.00280093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  37.5 
 
 		 617 aa  337  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  36.48 
 
 		 680 aa  337  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  35.81 
 
 		 702 aa  337  5.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  38.37 
 
 		 666 aa  336  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4454  dehydrogenase, E1 component  34.79 
 
 		 726 aa  335  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  35.92 
 
 		 710 aa  329  8e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1571  dehydrogenase E1 component  34.71 
 
 		 728 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4117  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  50.77 
 
 		 345 aa  320  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  33.54 
 
 		 678 aa  318  1e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  48.93 
 
 		 327 aa  319  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  48.93 
 
 		 327 aa  319  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  31.79 
 
 		 823 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  33.28 
 
 		 706 aa  316  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  52.02 
 
 		 320 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  47.99 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3050  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  50 
 
 		 332 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  46.88 
 
 		 324 aa  301  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.98 
 
 		 459 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  46.27 
 
 		 327 aa  300  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.3 
 
 		 469 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.34 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  44 
 
 		 325 aa  298  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0029  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  46.06 
 
 		 320 aa  296  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3772  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  46.15 
 
 		 320 aa  296  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.514041  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  50.47 
 
 		 332 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.75 
 
 		 467 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  49.68 
 
 		 324 aa  295  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  47.52 
 
 		 330 aa  293  7e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  42.77 
 
 		 326 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2782  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta subunit  30.24 
 
 		 727 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.89 
 
 		 467 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.6 
 
 		 465 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2230  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  48.15 
 
 		 346 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.753771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.15 
 
 		 332 aa  291  4e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  48.64 
 
 		 339 aa  290  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  47.53 
 
 		 324 aa  289  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  42.94 
 
 		 326 aa  290  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.06 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  47.45 
 
 		 333 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  47.45 
 
 		 333 aa  287  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  48.79 
 
 		 334 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  42.77 
 
 		 325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  49.22 
 
 		 330 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  47.15 
 
 		 340 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.2 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  47.34 
 
 		 331 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  47.15 
 
 		 340 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  47.15 
 
 		 340 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.99 
 
 		 469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  43.38 
 
 		 325 aa  284  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.82 
 
 		 480 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.71 
 
 		 328 aa  283  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.82 
 
 		 461 aa  282  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  45.37 
 
 		 327 aa  282  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.41 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  49.24 
 
 		 334 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.82 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.41 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.15 
 
 		 468 aa  282  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  46.85 
 
 		 346 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  50.62 
 
 		 335 aa  282  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  48.94 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  47.15 
 
 		 324 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  45.23 
 
 		 327 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.88 
 
 		 344 aa  281  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  44.44 
 
 		 327 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.01 
 
 		 483 aa  281  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  48.35 
 
 		 334 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.55 
 
 		 332 aa  281  4e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  47.15 
 
 		 324 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  40.92 
 
 		 325 aa  281  4e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  47.15 
 
 		 324 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  45.96 
 
 		 325 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.13 
 
 		 456 aa  280  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1217  Transketolase domain protein  44.82 
 
 		 330 aa  280  7e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  46.25 
 
 		 339 aa  280  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.15 
 
 		 324 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2033  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  46.91 
 
 		 328 aa  280  8e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.32 
 
 		 482 aa  280  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.58 
 
 		 344 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.58 
 
 		 344 aa  279  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  44.27 
 
 		 327 aa  279  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  45.06 
 
 		 330 aa  279  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  47.75 
 
 		 334 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.58 
 
 		 344 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  47.59 
 
 		 344 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>