More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2280 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  100 
 
 		 258 aa  511  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  53.94 
 
 		 221 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  75 
 
 		 131 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  75 
 
 		 131 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  73.28 
 
 		 136 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  72.88 
 
 		 198 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  70.09 
 
 		 140 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  52.31 
 
 		 395 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  37.85 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  54.29 
 
 		 104 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  54.29 
 
 		 142 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  54.29 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  51.43 
 
 		 105 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  51.43 
 
 		 105 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 125 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  53.33 
 
 		 129 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  36.04 
 
 		 157 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  50.96 
 
 		 104 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 124 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  53.54 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 98 aa  102  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  49.04 
 
 		 103 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  54.29 
 
 		 104 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 103 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  51.92 
 
 		 104 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  49.06 
 
 		 171 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 149 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  56.47 
 
 		 402 aa  99.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1177  hypothetical protein  57.14 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0930686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  45.28 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  49.52 
 
 		 104 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  97.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 104 aa  97.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 102 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  49.52 
 
 		 104 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1314  hypothetical protein  54.95 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0719888  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 104 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  44.04 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 123 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  92.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  45.61 
 
 		 115 aa  92  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 138 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  44.74 
 
 		 115 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 102 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 102 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  47.52 
 
 		 101 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  47.87 
 
 		 102 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  47.87 
 
 		 102 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  47.87 
 
 		 102 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  47.87 
 
 		 102 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 103 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  47.87 
 
 		 102 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 101 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  47.87 
 
 		 102 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 131 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  47.87 
 
 		 102 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  47.87 
 
 		 102 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3059  hypothetical protein  50.56 
 
 		 626 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 114 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  47.12 
 
 		 103 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 101 aa  89.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  89.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  46.81 
 
 		 102 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  46.81 
 
 		 102 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  46.81 
 
 		 102 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  89.4  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  30.16 
 
 		 208 aa  89.4  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 105 aa  89  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  89  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 103 aa  88.6  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>