More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1493 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 
697 aa  1432    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  93.97 
 
 
704 aa  1322    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  34.71 
 
 
702 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  34.16 
 
 
698 aa  361  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  34.43 
 
 
696 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  33.88 
 
 
696 aa  348  2e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.95 
 
 
696 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.95 
 
 
696 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 
714 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 
702 aa  302  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 
726 aa  301  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 
743 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  31.89 
 
 
655 aa  294  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.96 
 
 
695 aa  293  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 
698 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 
698 aa  290  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  28.95 
 
 
663 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 
698 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 
804 aa  287  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  28.97 
 
 
663 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  28.83 
 
 
653 aa  283  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  28.83 
 
 
666 aa  281  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  31.83 
 
 
665 aa  281  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  31.83 
 
 
665 aa  281  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  31.83 
 
 
665 aa  281  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  28.57 
 
 
666 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  28.13 
 
 
666 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  28.57 
 
 
666 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 
713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  28.43 
 
 
666 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  29.81 
 
 
652 aa  259  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  31.32 
 
 
676 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  29.03 
 
 
665 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  30.34 
 
 
656 aa  258  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  29.99 
 
 
732 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 
740 aa  256  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  27.58 
 
 
700 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 
652 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.69 
 
 
656 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  30.28 
 
 
680 aa  246  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 
698 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 
658 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  31.33 
 
 
572 aa  229  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 
715 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  28.05 
 
 
650 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  28.05 
 
 
650 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  28.05 
 
 
650 aa  221  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  26.62 
 
 
739 aa  221  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  28.05 
 
 
650 aa  220  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 
799 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 
799 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  27.9 
 
 
650 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 
799 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  28.59 
 
 
656 aa  218  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  28.2 
 
 
663 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 
663 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  28.51 
 
 
663 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  28.51 
 
 
663 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  28.2 
 
 
663 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  28.51 
 
 
663 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  28.53 
 
 
659 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  28.87 
 
 
641 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 
665 aa  210  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.28 
 
 
653 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
664 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
648 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
635 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 
657 aa  200  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 
806 aa  197  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
681 aa  197  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 
649 aa  190  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 
649 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
653 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 
661 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  28.07 
 
 
640 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 
680 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 
662 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 
649 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
662 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
662 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  24.74 
 
 
746 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  25.33 
 
 
759 aa  167  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  24.87 
 
 
746 aa  167  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  25.75 
 
 
724 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  25.61 
 
 
724 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  25.44 
 
 
724 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  25.61 
 
 
724 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  25.44 
 
 
724 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  25.96 
 
 
750 aa  160  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  24.4 
 
 
746 aa  157  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
634 aa  157  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1811  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  30.42 
 
 
330 aa  151  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  24.9 
 
 
783 aa  150  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  23.45 
 
 
757 aa  147  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  25.77 
 
 
742 aa  144  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  40.87 
 
 
326 aa  144  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  25.07 
 
 
703 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  24.87 
 
 
766 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  25.23 
 
 
742 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  25.44 
 
 
740 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>