More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2775 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 180 aa  353  5.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  77.22 
 
 		 180 aa  274  5e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  67.22 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  63.33 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  62.22 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 186 aa  158  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 184 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.09 
 
 		 769 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 873 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  35 
 
 		 867 aa  67.4  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  29.06 
 
 		 877 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  26.77 
 
 		 907 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 		 863 aa  65.1  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 863 aa  65.1  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  33.93 
 
 		 880 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  26.72 
 
 		 865 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  28.57 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.13 
 
 		 873 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  31.25 
 
 		 875 aa  61.6  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  30.36 
 
 		 875 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.82 
 
 		 845 aa  61.6  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 875 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  33.04 
 
 		 888 aa  58.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  26.43 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  28.79 
 
 		 880 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.4 
 
 		 499 aa  58.2  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  32.76 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  25.58 
 
 		 885 aa  55.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  29.69 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.32 
 
 		 877 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  31.03 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  27.78 
 
 		 909 aa  55.1  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  32.74 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.15 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  30.43 
 
 		 904 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  31.09 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  29.66 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  27.78 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  32.37 
 
 		 366 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  28.8 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  29.37 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  25.34 
 
 		 386 aa  53.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  28.68 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  28.47 
 
 		 874 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  28.32 
 
 		 904 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.58 
 
 		 487 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  25.36 
 
 		 881 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  27.87 
 
 		 897 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  33.91 
 
 		 214 aa  51.6  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.54 
 
 		 487 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  30.09 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  28.32 
 
 		 907 aa  52  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.58 
 
 		 487 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  30.17 
 
 		 636 aa  51.2  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  26.32 
 
 		 880 aa  51.2  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.58 
 
 		 487 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  31.03 
 
 		 139 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  23.48 
 
 		 883 aa  51.2  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  29.08 
 
 		 479 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  27.34 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  26.87 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.66 
 
 		 903 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  24 
 
 		 890 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  27.41 
 
 		 688 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  30 
 
 		 435 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  27.42 
 
 		 641 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  27.7 
 
 		 872 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  51.92 
 
 		 112 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  28.06 
 
 		 229 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.43 
 
 		 491 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  29.57 
 
 		 863 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  52.08 
 
 		 119 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  28.07 
 
 		 880 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.89 
 
 		 903 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 		 366 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 99 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>