44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0570 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  100 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  73.13 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  53.85 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  47.95 
 
 		 224 aa  138  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  43.24 
 
 		 347 aa  132  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  44.59 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  45.22 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  45.73 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  54.7 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  52.25 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  51.49 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  38.01 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  47.96 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  41.53 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  30.22 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  38.89 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  35.56 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  35.56 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  35.56 
 
 		 119 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  34.02 
 
 		 807 aa  52  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  30.83 
 
 		 144 aa  52  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  35.56 
 
 		 116 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  34.07 
 
 		 116 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.86 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  35.16 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  34.44 
 
 		 126 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  32.97 
 
 		 116 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  27.71 
 
 		 138 aa  48.9  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  50 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  35.56 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  28.07 
 
 		 127 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  28.04 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  33.33 
 
 		 116 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  34.44 
 
 		 116 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  32.22 
 
 		 119 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  31.76 
 
 		 119 aa  45.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  37.97 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  31.82 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  33.33 
 
 		 116 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  36.99 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  37.8 
 
 		 255 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  34.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  36.14 
 
 		 110 aa  41.6  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  39.53 
 
 		 150 aa  41.6  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>