39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0141 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 167 aa  332  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  66.87 
 
 		 159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  64.07 
 
 		 159 aa  216  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  66.47 
 
 		 160 aa  215  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  62.42 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  42.26 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  43.71 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  39.76 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  38.71 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  36.31 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  33.94 
 
 		 170 aa  90.5  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  32.74 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  37.7 
 
 		 159 aa  87.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  37.7 
 
 		 159 aa  87.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  38.52 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  37.7 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  32.74 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  27.98 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  33.96 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  37.5 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  37.76 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  38.37 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  33.64 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  38.75 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  28.23 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  33.75 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  46.67 
 
 		 633 aa  52.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  33 
 
 		 464 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  31.62 
 
 		 466 aa  51.2  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  30.4 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  28.4 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  34.95 
 
 		 469 aa  48.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  28.57 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.25 
 
 		 580 aa  47.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  22.84 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  31.37 
 
 		 469 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  30.6 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  30.77 
 
 		 253 aa  45.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  26.67 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>