291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0005 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 360 aa  714    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  71.39 
 
 		 361 aa  511  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  66.67 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  67.41 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  69.25 
 
 		 369 aa  471  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  31.02 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  30.89 
 
 		 382 aa  119  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  32.09 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  29.59 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  34.26 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  30.46 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  31.18 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  32.52 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.37 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 390 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 392 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.23 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.76 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  32.17 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  24.11 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  31.94 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  30.42 
 
 		 407 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.9 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.67 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.86 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  25.52 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.9 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.52 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.93 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  28.16 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  21.99 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  27.09 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  30.59 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.92 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.04 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.23 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  25.06 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  32.37 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  21.33 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  22.03 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  21.6 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  29.32 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  21.04 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  33.12 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 434 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  24.14 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  26.29 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  29.18 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  22.41 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  29.18 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  29.18 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  24.09 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  22.64 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  26.98 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  24.34 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  28.48 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.38 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>