More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2514 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  100 
 
 
405 aa  794    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0462  ABC transporter related protein  68.8 
 
 
363 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0150291  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  54.09 
 
 
374 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  55.89 
 
 
352 aa  362  8e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  59.27 
 
 
352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.76 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.06 
 
 
370 aa  295  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 
370 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 
384 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.9 
 
 
373 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.91 
 
 
372 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.83 
 
 
382 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  45.03 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.45 
 
 
359 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.59 
 
 
356 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  51.64 
 
 
381 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.57 
 
 
352 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.45 
 
 
356 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  45.19 
 
 
353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  48.56 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  45.14 
 
 
353 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.32 
 
 
353 aa  283  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  51.64 
 
 
356 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.55 
 
 
363 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  44.06 
 
 
349 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.63 
 
 
366 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.16 
 
 
365 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  43.77 
 
 
349 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  43.15 
 
 
351 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  42.06 
 
 
376 aa  280  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.77 
 
 
360 aa  280  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.26 
 
 
372 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.49 
 
 
368 aa  279  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.01 
 
 
378 aa  279  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.01 
 
 
378 aa  279  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.01 
 
 
378 aa  279  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  47.04 
 
 
368 aa  278  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.65 
 
 
378 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.65 
 
 
378 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.65 
 
 
378 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  51.65 
 
 
378 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.65 
 
 
378 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.65 
 
 
378 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 
353 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.62 
 
 
372 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  44.63 
 
 
356 aa  276  5e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 
353 aa  276  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.5 
 
 
382 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 
349 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  50.55 
 
 
371 aa  275  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.6 
 
 
374 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.18 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.55 
 
 
447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.82 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.28 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.31 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.29 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
348 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.29 
 
 
374 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.28 
 
 
378 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.29 
 
 
374 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.28 
 
 
378 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.28 
 
 
378 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.28 
 
 
383 aa  274  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  48.83 
 
 
352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 
354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.64 
 
 
371 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 
348 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  52.63 
 
 
377 aa  273  6e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.82 
 
 
426 aa  272  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  43.95 
 
 
348 aa  272  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  44.41 
 
 
363 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  52.03 
 
 
384 aa  272  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
347 aa  271  2e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  47.32 
 
 
357 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.04 
 
 
408 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.7 
 
 
373 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.72 
 
 
380 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.33 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  44.38 
 
 
353 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 
357 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.67 
 
 
362 aa  270  4e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.45 
 
 
381 aa  269  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.53 
 
 
358 aa  269  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  46 
 
 
356 aa  269  5e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.85 
 
 
354 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.06 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  45.72 
 
 
369 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  48.53 
 
 
352 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  50.92 
 
 
362 aa  269  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  45.98 
 
 
341 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.01 
 
 
384 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.45 
 
 
377 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.92 
 
 
372 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  45.13 
 
 
347 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  52.59 
 
 
359 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  52.77 
 
 
356 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 
355 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  48.53 
 
 
352 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>