More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2420 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2420  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1173  TrkA-N domain protein  82.79 
 
 		 221 aa  336  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  63.72 
 
 		 218 aa  281  5.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1539  TrkA-N domain protein  61.4 
 
 		 222 aa  265  4e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  51.39 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  50.46 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 228 aa  215  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1602  TrkA-N domain protein  52.31 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.316093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  31.19 
 
 		 443 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  32.46 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  32.41 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  31.76 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  28.05 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  29.49 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  26.24 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  31.08 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  25.33 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  29.82 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  24.66 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  29.02 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  28.63 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.02 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  33.82 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  30.63 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  26.61 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  30.67 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  29.6 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  27.1 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 		 620 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  31.78 
 
 		 452 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  24.34 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  24.34 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  25.45 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  25.45 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  25.45 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  25.45 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  25.45 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  25.45 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  25.45 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  25.45 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  25.45 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  28.1 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  29.28 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1358  potassium transporter peripheral membrane component  28.95 
 
 		 458 aa  65.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  26.79 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  28.84 
 
 		 454 aa  66.2  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28.74 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  27.48 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  26.67 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  26.83 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  23.29 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  26.61 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  29.09 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  29.09 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.12 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  28.32 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  30.66 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  26.24 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  37.8 
 
 		 617 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3473  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  28.82 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  30.29 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  25.69 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  45.12 
 
 		 617 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  29.81 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  27.91 
 
 		 331 aa  62  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 		 137 aa  62  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 		 457 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  30.33 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  24.55 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  28.16 
 
 		 449 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  31.25 
 
 		 465 aa  61.6  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  25.12 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2218  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000230921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1640  K+ transport systems NAD-binding component, TrkA-N  28.31 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  25.35 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  31.82 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  26.61 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  25.69 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4814  TrkA-N domain protein  25.45 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  27.62 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  25.47 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  38.74 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>