More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14130 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 489 aa  983    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  44.81 
 
 		 564 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  44.9 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  42.59 
 
 		 562 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  42.57 
 
 		 559 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  46.38 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  40.33 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  42.08 
 
 		 496 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  41.9 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  38.49 
 
 		 525 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  42.12 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40 
 
 		 531 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  39.31 
 
 		 497 aa  359  7e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  39.11 
 
 		 497 aa  358  8e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  39.96 
 
 		 489 aa  355  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  39.96 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  39.96 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  39.96 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  39.34 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  39.34 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  39.34 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  39.75 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  39.34 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  39.34 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  39.75 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  39.34 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  39.75 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  39.34 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  39.58 
 
 		 492 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  39.34 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  39.75 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  39.53 
 
 		 530 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  39.75 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  37.09 
 
 		 483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  40.17 
 
 		 489 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  40 
 
 		 489 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  40 
 
 		 489 aa  348  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  38.17 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  39.59 
 
 		 489 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  41.62 
 
 		 507 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  39.38 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  42.71 
 
 		 571 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  39.12 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  39.33 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  40.4 
 
 		 500 aa  345  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  38.01 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  41.48 
 
 		 502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  41.42 
 
 		 503 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  39.18 
 
 		 489 aa  340  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  36.51 
 
 		 496 aa  340  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  36.51 
 
 		 496 aa  340  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  39.44 
 
 		 489 aa  340  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  39.47 
 
 		 488 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  41.03 
 
 		 502 aa  339  8e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  37.94 
 
 		 483 aa  338  9e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  37.72 
 
 		 517 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  39.26 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.57 
 
 		 543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  40.78 
 
 		 517 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  39.08 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  38.87 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  39.26 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  39.26 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  37.4 
 
 		 499 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  39.06 
 
 		 502 aa  334  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  37.1 
 
 		 636 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  38.17 
 
 		 496 aa  334  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  39.48 
 
 		 500 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3734  ribonuclease G  40.56 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0562  ribonuclease G  40.22 
 
 		 500 aa  333  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.229601  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  37.07 
 
 		 488 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  38.52 
 
 		 489 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  37.78 
 
 		 515 aa  332  8e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  38.52 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  41.47 
 
 		 485 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  38.85 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  37.25 
 
 		 495 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  39.67 
 
 		 496 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  37.25 
 
 		 495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  41.24 
 
 		 485 aa  329  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  41.24 
 
 		 485 aa  329  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  41.71 
 
 		 485 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  38.85 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  42.09 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  38.85 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  39.29 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  38.85 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  41.61 
 
 		 492 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  41.12 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  36.69 
 
 		 512 aa  327  3e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  40.52 
 
 		 495 aa  327  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  41.24 
 
 		 485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2622  ribonuclease  37.53 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134326  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  36.67 
 
 		 501 aa  326  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  41.47 
 
 		 485 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  41.47 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  41.47 
 
 		 485 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  40.6 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  36.17 
 
 		 537 aa  324  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  41.24 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>